内容
64bit Windows 10に導入
64bit WindowsにMNE-pythonをインストールしてみました。ネット環境につながっている必要があります。64bit Anaconda3はインストール済みです。
Windowsのコマンドプロンプトを開きます。
Linuxと違い、WindowsではUNIX/OSXのいくつかのコマンドは使えません。Anacondaにはscipyやmatplotlibはインストールされてい入るのですが、MNE-pythonのホームページに従い、以下のようにscipy、matplotlib、scikit-learnをインストールしてみます。
どんどんインストールされていきます。途中でyと入力します
scipy、matplotlib、scikit-learnがインストールされました。
MNE-pythonのホームページではipython –matplotlib=qtが動作するか確認するようになってます。
Windows版ではどうもうまく作動しませんでした。
Anaconda自体にはipythonは含まれているので無視することにします。
exit()でpythonから抜けます。
Anacondaにはspyderが含まれているのですが、MNE-pythonのホームページに従ってインストールしてみます。
pipを使ってMNE-pythonをインストールします。
import mneとやってエラーが出なかったらOKらしいです。
とりあえずエラーは出ませんでした。
実際にraw_fiffファイルが読めるかどうか試してみました。
なんか読めたっぽいです。
64bit CentOS 6.8に導入
MNEのホームページに沿ってMNE-pythonをインストールしてみます。usernameはnsです。
condaを使ったscipy matplotlib scikit-learnのインストール
conda install scipy matplotlib scikit-learn
はうまくいきますが、ipythonで検証
ipyhon –matplotlib=qt
はうまくいきませんでした。
anacondaインストール時点でちゃんとmatplotも組み込まれているので、エラーが出ますが無視することにします。
ipythonが起動しているのでexit()で抜けます。
condaを使ってspyderをインストールします。
conda install spyder
pipコマンドを使ってMNE-pythonをインストールしようとするとpipコマンドそのものをupgradeしなさいと言われますので、指示通りpipをupgradeします。
pip install mne –-ugrade
pip install –-upgrade pip
もう一度MNE-pythonをインストールしてみます。
pip install mne –upgrade
ちゃんとインストールされたか探してみました。
/home/ns/anaconda3/lib/python3.5/site-packagesにmneというフォルダがありました。
Terminalでspyderを起動し、
import mne
でMNE-pythonを組み込んだのち、
raw=mne.io.read_raw_fif(‘epilepsy1.fif’,preload=True)
でepilepsy1.fifを読み込んでみます。
ちゃんと認識したみたいです。
OSX 10.8 (Mountain Lion)に導入
Terminalを開いてcondaのversion、どのpythonかを聞きます。
condaを使ったscipy matplotlib scikit-learnのインストールを行います。途中でyボタンを押します。
無事インストールされました。
ipyhon –matplotlib=qtを試せと有りますが、Windows、Linuxともうまくいきません。OSXは・・・
ちゃんとエラーがでましたが、Windows、Linuxとは違ってipythonには入っていないようです。
condaを使ってspyderをインストールします。途中でyボタンを押します。
無事インストールできました。
次にpipコマンドを使ってMNE-pythonをインストールします。
pip自体をupgradeしなさいといわれるのでそうします。
spyderを起動してみます。
mneの動作確認をします。
とりあえずraw.fifは読めました。