BrainSuiteによる脳の切り出し・メッシュ化

BrainStuiteを起動します。

〇〇.nii.gzをドラッグします。

ファイルが読み込まれました。

紫のところはドラッグすれば回転します。その他は、クリックすると断面の位置が変わります。

Cortex→Cortical Surface Extraction Sequenceをクリックします。

Run Allをクリックします。Register and label brainのチェックは外しておきます。

途中です。なんか実行中。

終了しました。Intel Core i5 8250Uで約6分くらいです。

脳ボクセルの抽出と脳メッシュ化がなされています。

抽出された脳ボクセルが表示されます。

緑は大脳部分だけのボクセルからなるマスクの領域です。

右下は赤が右大脳皮質軟膜メッシュ、青が左大脳皮質軟膜メッシュです。

因みにRegister and label brainも実行するとIntel Core i5 8250で約70分かかりました。

脳皮質の区分がなされています。