MRIcronのインストール

BrainSuiteが扱う脳の三次元画像はAnalyze形式かNIfTI形式です。

DICOMファイルからNIfTI形式のファイルに変換するにはフリーウェアであるMRIcronなどが使われます。

なお、MATLABで稼働するSPM12でもNIfTI形式のファイルを作成することができます。

MRIcronのホームページから、Download the file win.zipをクリックします。

win.zipをクリックします。

I Agreeをクリックします。

win.zipを保存し、適当な場所で展開してください。

DICOMファイルからNIfTIファイルの作成

DICOMからNIfTIファイルを作成するにはdcm2niigui.exeをダブルクリックします。

DICOMファイルをdcm2niiにドラッグすれば、NIfTIファイルが作成されます。

DICOMファイルがあったフォルダに〇〇.nii.gzファイルとco〇〇.nii.gzファイルが作成されました。

dcm2niiは終了します。作成された２つのnii.gzファイルの違いを見てみます。

mricron.exeを起動します。

coのついてない〇〇.nii.gzをドラッグします。

Window→Informationをクリックします。

大きさは256×256×86です。

co〇〇.nii.gzをドラッグしてみます。

大きさは192×221×86です。co〇〇.nii.gzは〇〇.nii.gzをトリミングしたもの、ということがわかりました。