Analyze format

MRIcroで作成されるAnalyze formatは*.hdrと*.imgの２つのファイルから構成されます。

*.hdr	*.imgを読むための各種情報
*.img	binaryで書かれた実際のデータ

*.hdrは348byteからなるfileで以下のformatになっています。
FOV 250mm、スライス厚の1.25mm、512×512×125スライスのCT画像をMRIcroで認識させ、 hdrファイルを作成、binary editorで見てみました。Little Endianです。

　　

16進数	型	Cの変数	data
5C01 0000	int	file size	348byte
00が10個	char	data type	なし
00が18個	char	db_name	なし
0000 0000	int	extents	なし
0000	short int	session_error	なし
72	char	regular	r
00	char	hkey_un0	なし
0400 0002 0002 7D00 0100	short int	dim	4,512,512,125,1
0000が3個	short_int	dim続き	0,0,0
0000が7個	short int	unused	使用せず
0400	short int	datatype	4
1000	short int	bitpix	16bit
0000	short int	dim_um0	使用せず
0000803F F8FFF93E F8FFF93E 0000A03F	float	pixdim	1,0.4883,0.4883,1.25
00000000が4個	float	pixdim続き	0,0,0,0
00000000	float	vox_offset	0
0000803F 000080C4 00000000	float	funused1〜3	1,-1024,0
00000000	float	cal_max	0
00000000	float	cal_min	0
00000000	float	cal_compressed	0
00000000	float	verified	0
FF000000 00000000	int	glmax,glmin	255,0
53746172744163712F496D672054696D	char	descrip	StartAcq/Img Tim
653A203133323734342F313332373535	char	descrip続き	e: 132744/132755
20456E644163712F496D672031333237	char	descrip続き	EndAcq/Img 1327
34342F31333331343100000000000000	char	descrip続き	44/133141
00が16個	char	descript続き	なし
00が120個	いろいろ	いろいろ	なし

regular 表へ

通常r。voxel sizeはどれも同じ大きさという意味。

dim 表へ

次元（通常4）,Xの数,Yの数,Zの数,時間の数

datatype 表へ

none	0
binary	1
unsigned char	2
signed short	4
signed int	8
float	16
complex	32
double	64
RGB	128
all	255

pixdim 表へ

voxelの次元?,voxelのXの幅,Yの幅,slice厚