MRIcroの3D機能3

SPMの解剖画像に機能画像を重ね合わせて表示させます。 ここでは解剖画像と機能画像の座標、voxelの大きさが一致していると仮定しています。
MRIcroを起動し、脳を切り出した*.hdrファイルを読みます。

メニューバーのOverlay->Load functional overlay...を選び、機能画像*.hdrを選択します。

機能画像の値の範囲に合わせて、Display、PositiveまたはNegativeのrangeを設定します。 ここでは正値のみ最大値60からなる機能画像を想定し、DisplayをPositive ValueにPositive Rangeを0〜30としています。

Applyボタンを押し、好みの表示なっているかどうか検討しますが、途中で上記設定を変えることはできません。 再度Overlay->Load functional overlay...を選びなおす必要があります。
表示条件が問題なければを押し、 Render ウインドウのOverlay ROI/Depthにクリックを入れます。

視線を任意の角度にするにはRenderウインドウ右下のボタンをクリックし、Azimuth（方位角）、Elevation（仰角）を指定します。

RenderウインドウのCutoutにcheckを入れ、 Cutout sectorウインドウに切り取るboxの大きさを指定します。

Cutout sectorウインドウを閉じる指定したboxの大きさで切り取られた画像が表示されます。

RenderウインドウのCutoutのcheckを外すと、元の画像に戻ります。