DICOM読み込み

メニューバーからFile->Newを選択します。

Create Project画面の、Anatomical 3D data set (VMR)を選択し、File typeはDICOMとします。
3D化するDICOMファイルの枚数を指定し、Select first source fileボタンを押して最初のDICOMファイル名を選択します。 最後にStartボタンを押します。

計算中

MRIファイルが読み込まれました。

読み込まれたMRIのSAG、COR、TRAは正しくありません。修正します
次にメニューバーからOptions->3D volume tools...を選択します。

3D Volume ToolsのSpatial TransfタブのStandardizeのTo SAGボタンを押します。

SAG画面がTRA画像で前向きになっているので、Traの一番上のチェックボックスをクリックし、Rearrangeボタンを押します。

SAG画面はSAG画像なのですが、上下逆になっています。

再度3D Volume ToolsのTo SAGボタンを押し、 今度はSagの一番上のチェックボックスをクリックし、Rearrangeボタンを押します。

これで漸くX・Y・Z座標が一致しました。 光学的右手系・左手系が異なる場合にはFlip X-axisをチェックして再度Rearrangeボタンを押します。 次に縦・横・高さの比を修正します。
3D Volume ToolsのTo iso-voxelボタンを押し、X、Y、Zの1 boxelの値を入れ、 Trilinear interpolationにチェックを入れ、OKボタンを押します。 尚、Sinc interpolationのままでOKボタンを押すと、Brain Voyagerはfreezeします。強制終了させる必要があります。bugです。

保存すべきファイル名を聞いてきます。適当に名前をつけると、新たな3D画像が表示されます。

古い3D画像のwindowは不要ですので消去します。これで準備完了です。